Если с закрытыми  крышками камеры сгорания котёл через короткое время после розжига горелки уходит в ошибку по потере пламени (Е01), а при открытых крышках продолжает работать, то, как правило, это свидетельствует о попадании дымовых газов в приток воздуха, либо о недостаточном поступлении воздуха для горения (например, превышена максимальная длина труб притока воздуха). Простыми словами можно сказать, что котёл "задыхается".
Частой, но визуально трудно диагностируемой причиной является некорректно собранный коаксиальный дымоход, например соскочившая прокладка между трубами выхода продуктов сгорания (так как снаружи все выглядит корректно).
Из нелепых, но периодически встречающихся ситуаций отметим также прямое присоединение одной  дымоходной трубы к внешнему коаксиальному патрубку (без всяких переходных комплектов).