Для обогрева помещения устанавливают необходимую температуру теплоносителя в соответствии с имеющейся системой отопления, температурой на улице и теплоизоляцией здания. При изменении температуры на улице пользователь меняет заданную температуру теплоносителя на котле.

Чтобы реже подходить к котлу, а также для экономии газа, настоятельно рекомендуется использование комнатного термостата, который устанавливается в наиболее характерной точке помещения (чаще всего — в спальне). Температуру теплоносителя в таком случае рекомендуется устанавливать близкую к максимальной (70–80°C), либо также изменять вручную в зависимости от температуры на улице. Для точного регулирования температуры в помещении площадью более 100 кв. м рекомендуется также использование датчика уличной температуры для погодозависимого регулирования. При этом крайне желательна корректная гидравлическая балансировка системы отопления специалистом.

Для использования горячей воды из бойлера обычно устанавливают температуру от 40°C до 60°C. Температура 40°C позволяет пользоваться горячей водой практически без смешения с холодной водой. Температура 60°C позволяет иметь изначальный большой запас горячей воды, что актуально, например, при заполнении ванны или одновременной работе на несколько точек потребления.

При использовании котла с проточным вторичным теплообменником обычно устанавливают такую температуру горячей воды, которую еще может выдержать рука (40 - 45°C), так как большей температуры не требуется.